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Commit 2bc1148a authored by Manuel Grizonnet's avatar Manuel Grizonnet
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WIP: start new exercise about otb python app

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1 merge request!2Otb app python
** Utiliser les applications OTB en Python :slides:
*** Objectifs et données
**** Objectifs
- Savoir configurer l'environnement pour utiliser les applications en Python
- Savoir paramétrer une application en Python
- Savoir utiliser la connexion en mémoire entre applications
- Utiliser le bridge entre OTB et NumPy
**** Données
Les données se trouvent dans le répertoire ~Data/otb-python/~.
*** Déroulement
Le TP consiste à mettre en place un script Python pour réaliser l'extraction
des surfaces en eaux dans une série d'images Sentinel-2
*** Rapide intro aux OTB-Applications
- Orfeo ToolBox est une *bibliothèque* offrant des fonctionnalités de télédétection
- Souvent nécessaire de combiner plusieurs fonctions (filtres) OTB dans une
chaîne de traitements
- Besoin d'interface de plus haut niveau (paramètres, les données d'entrée et
de sortie, les logs...)
- Chaque application correspond à une fonctionnalité de "haut niveau"
(segmentation, orthorectification, segmentation, calculatrice sur les bandes...)
- Correspond à une classe C++ (/otb::Application/) $\rightarrow$ librairie
- Mécanisme de plugin
- Possibilité de développer et distribuer ces applications /maison/
*** Rapide intro aux OTB-Applications
- En ligne de commande $\rightarrow$ otbcli\textunderscore{}Orthorectification
- Dans une interface graphique $\rightarrow$ otbgui\textunderscore{}Orthorectification
- En Python:
#+begin_src python
import otbApplication
orth=otb.Registry.CreateApplication("OrthoRectification")
#+end_src
- Intégrées dans QGIS $\rightarrow$ Menu /processing/
- Intégrées dans Monteverdi
*** GUI
#+begin_center
#+ATTR_LaTeX: width=0.95\textwidth center
[[file:../../../Slides/OTB-General/images/app_parameters.png]]
#+end_center
*** Paramétrage
- Afficher l'aide de l'application d'OrthoRectification (bon exemple)
- Notion de /groupe de paramètres/
- Notion de /paramètre obligatoire/
- Dépendance entre paramètres (dynamique)
- Valeur par défaut
- Type des images en sortie (par défaut flottant)
*** Autre Exemple: BandMath
- Calculatrice raster
- Utilise la librairie MuParser
- Prend en entrée une liste d'images (paramètre /-il/)
- Codage des expressions mathématiques:
- imXbY:
- X: numéro de l'image dans la liste (de 1 à N)
- Y: numéro de la bande dans l'image X (de 1 à N)
- [[http://muparser.beltoforion.de/mup_features.html][Liste des opérateurs mathématiques disponibles]]
- Exemples:
- -exp "(im1b4 - im1b1) / (im1b4 - im1b1))"
- -exp "acos((123*im1b1+265*im1b2+652*im1b3) \\
/ (sqrt(123*123+265*265+652*652)\\
*sqrt(im1b1*im1b1+im1b2*im1b2+im1b3*im1b3)))"
- -exp "im1b1>0.5?255:0"
*** Liens utiles
- [[https://www.orfeo-toolbox.org/CookBook/CookBookse1.html#x7-60001.1][Introduction aux OTB applications]]
- [[https://www.orfeo-toolbox.org//Applications/][Documentation de référence des applications]]
- [[https://www.orfeo-toolbox.org/CookBook/CookBookch3.html#x38-370003][Exemples utilisation des OTB applications]]
- Aide d'une application: /otbcli\textunderscore{}XXX -help/
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